В отборочных соревнованиях ЮФО-СКФО приняла участие 21 команда (в 2015 году — 20) из девяти регионов Юга страны. Турнир прошёл по олимпийской системе. Все призёры получают право продолжить борьбу за Кубок РФС в российском финале, который пройдёт предположительно в Крымске с 15 по 25 октября 2016 года.
За 1 место 29 июля (в Пятигорске):
«Юность» (Владикавказ) – «АФ-КК» (Краснодар) – 1:2
За 3 место 29 июля (в Пятигорске):
«Барс» (Владикавказ) – «Афипс» (Афипский) – 1:0
1/2 финала:
«Барс» (Владикавказ) – «Юность» (Владикавказ) – 0:1 и 1:1.
«Афипс» (Афипский) – «АФ-КК» (Краснодар) – 1:3 и 0:5.
1/4 финала:
«Юность» (Владикавказ) – «Волгарь» (Астрахань) – 0:0 и 3:2.
«Ангушт» (Назрань) – «Барс» (Владикавказ) – 0:2 (в Нальчике).
«ДЮСШ» (Ставрополь) – «АФ-КК» (Краснодар) – 0:2 и 1:3.
«Кубань» (Краснодар) – «Афипс» (Афипский) – 2:1 и 0:2.
1/8 финала:
«Волгарь» (Астрахань) – «Астрахань» (Астрахань) – 2:1 и 4:1.
«Юность» (Владикавказ) – «Легион-Динамо» (Махачкала) – 2:0 и 5:1.
«Спартак-Нальчик» (Нальчик) – «Ангушт» (Назрань) – 0:2 и 0:1.
«Машук-КМВ» (Пятигорск) – «Барс» (Владикавказ) – 0:3 и 0:2.
«ДЮСШ» (Ставрополь) – «Биолог-Новокубанск» (Прогресс) – 9:2 и 3:1.
«Дружба» (Майкоп) – «АФ-КК» (Краснодар) – 0:2 и 2:1.
«Черноморец» (Новороссийск) – «Кубань» (Краснодар) – 0:14 и 0:3.
«Афипс» (Афипский) – «СКА» (Ростов-н/Д) – 3:0 и 3:0.
1/16 финала:
«Барс» (Владикавказ) – «Спартак-Алания» (Владикавказ) – 2:0 и 1:0.
«ДЮСШ» (Ставрополь) – «Чайка» (Песчанокопское) – 1:2 и 5:2.
«Армавир» (Армавир) – «Биолог-Новокубанск» (Прогресс) – 1:5 и 4:4.
«Сочи» (Сочи) – «Дружба» (Майкоп) – 0:1 и 2:2.
«АФ-КК» (Краснодар) – «Динамо-Ставрополь» (Ставрополь) – 4:0 и 2:0.